Comparer deux méthodes de mesure (Passing-Bablok, Deming)

En bref

Deux méthodes de mesure ont mesuré les mêmes échantillons. La comparaison de méthodes sous « Les évaluations concordent-elles ? » (avec exactement deux colonnes numériques, à côté de Bland-Altman) montre si elles diffèrent d’une quantité fixe (constante différente de 0) ou d’un facteur (pente différente de 1). Les deux procédures, Passing-Bablok et Deming, traitent les deux mesures comme entachées d’erreur ; une régression ordinaire ne le ferait pas et donnerait une pente trop faible.

Passing-Bablok

• Calcule comme le package R mcr (version 1.3.3.1) : médiane des pentes de toutes les paires de points, décalée selon la règle de Passing et Bablok, mesure d’angle, intervalle analytique. Il est robuste aux valeurs aberrantes et n’exige pas de loi normale.
• Elle est bloquée en présence de valeurs négatives (comme dans mcr ; décaler les données modifierait la constante, ce qui n’est pas fait) et en cas d’association non positive. Elle exige des valeurs continues : avec moins de 20 valeurs différentes, une remarque apparaît et l’intervalle devient grossier. Elle compare chaque paire avec toutes les autres, de sorte que 4 000 échantillons au plus sont autorisés.
• Le test de linéarité cusum n’affiche que la statistique de test h et le diagramme des résidus, pas de valeur p : la formule de la valeur p n’est pas documentée dans l’original. Une valeur sans particularité n’est pas la preuve de la linéarité.

Deming et le rapport λ

• λ est la variance d’erreur de la mesure sur l’axe horizontal divisée par celle sur l’axe vertical. La valeur par défaut est λ = 1 : les deux méthodes mesurent avec une erreur de même grandeur. Le sens diffère dans chaque programme ; Statable suit le package R mcr.
• λ peut être déterminé à partir de mesures répétées (deux mesures par échantillon et par méthode), et non à partir des seules données de la comparaison. Un λ erroné fausse la droite ; un tableau montre la pente pour λ = 0,5, 1 et 2, afin de voir à quel point λ compte. L’intervalle provient du jackknife selon Linnet (1990).

Lire le résultat

• Si l’intervalle de la constante ne contient pas 0, il y a un indice d’un écart constant ; si celui de la pente ne contient pas 1, un indice d’un écart proportionnel. Ce n’est qu’un indice, et non la preuve que les méthodes sont équivalentes ou qu’elles diffèrent.
• Le graphique montre les échantillons, la droite d’identité (identity line) y = x (en pointillés) et les deux droites. La droite ne vaut que dans l’étendue des valeurs mesurées. Bland-Altman montre les différences par rapport à la moyenne, Passing-Bablok et Deming la droite ; les deux vont ensemble.
• Avec un poids de l’observation, la comparaison de méthodes est bloquée : chaque échantillon compte une fois.

Pour les spécialistes

Passing-Bablok suit calc_PaBa de mcr pas à pas (différence de tolérance 1e-12, décalage à partir d’angles jusqu’à −π/4, règle des rangs, C arrondi à un nombre entier) et concorde avec mcr et avec les jeux de référence du programme « Calanas » du test du package à 1e-9 près. Deming : Linnet (1990), jackknife avec t(n − 2), comme mcr. Sources : Passing et Bablok (1983), J Clin Chem Clin Biochem 21, 709-720 ; Linnet (1990), Statistics in Medicine 9, 1463-1473.